免疫异常是白癜风发病的重要原因之一，因此白癜风常伴发多种自身免疫性疾病，而一些自身免疫性疾病的病情变化可直接影响到白癜风的病情，如甲状腺疾病、糖尿病、阿迪森病、自身免疫性多腺体综合症，恶性贫血、类风湿性关节炎等疾病。甲状腺疾病包括甲状腺功能亢进、慢性淋巴性甲状腺炎、原发性特发性甲状腺功能减退等。临床上我们经常见到白癜风伴发甲状腺疾病的比例达到了7.5%。同时部分白癜风患者的T3、T4、TG抗体和TM抗体水平明显升高，提示白癜风患者发生甲状腺疾病的风险较大。而且我们在泛发性和局限性白癜风患者的血清中常常能查到甲状腺球蛋白抗体、抗甲状腺微粒体抗体，这也从一个方面证明了白癜风患者可能有自身免疫异常。白癜风为何常伴甲状腺疾病呢？这可能与白癜风患者具有自身免疫性疾病的遗传易感性，甲状腺功能亢进时过多合成的甲状腺素消耗了过多的酪氨酸，同时褪黑素水平的升高也与甲状腺疾病有关。糖尿病也是与白癜风常伴发的一个疾病。有学者做过统计白癜风患者的糖尿病患病率约为1.6~7.1远高于自然人群患病率，同时白癜风患者抗肫岛素细胞抗体也远远高于正常人，白癜风伴发糖尿病可以与患者的自身免疫及遗传易感性有关。阿迪森病也为一种自身免疫性疾病，有调查统计显示阿迪森病合并白癜风的比率为5.4%，部分白癜风患者抗肾上腺抗体、血浆皮质醇水平明显高于正常对照组，再次证明白癜风患者有自身免疫异常。阿迪森病常并发白癜风，考虑与阿迪森患者功能过于活跃。产生过多的中间代谢产物损伤黑素细胞所致。有学者报告：白癜风患者自身免疫性疾病发生率较非白癜风病人高1000倍，这点较充分的说明白癜风病人自身免疫的异常。据临床观察自身免疫性疾病患者中白癜风的患病率比一般人高10-15倍。